Несколько исследовательских групп пытались создать компактные системы CRISPR, которые можно было бы вписать в один вектор AAV, сохранив при этом возможности редактирования. Группа Mammoth Biosciences — одна из них; они могли бы добиться успеха. Ее исследователи начали с сортировки информации о генетической последовательности из нескольких типов CRISPR, которые встречаются в микроорганизмах.
Лукас Харрингтон, главный научный сотрудник компании, соучредитель и бывший студент Дудны, утверждает, что после того, как первоначальные 176 претендентов прошли «шквал тестов», они обнаружили «ту самую иголку в стоге сена». Лучший выбор получил название NanoCas; при 425 аминокислотах он примерно на треть длиннее Cas9. Он был разработан Харрингтоном и его коллегами для эффективного разрезания ДНК млекопитающих.
Основные выводы исследования NanoCas включают в себя:
- Эффективность редактирования соответствует эффективности систем CRISPR первого поколения: при воздействии на ген PCSK9 в печени мыши in vivo NanoCas показал насыщающую эффективность редактирования приблизительно 60%, наравне с SaCas9, который примерно в три раза больше по размеру. Обе системы CRISPR снизили сывороточный белок PCSK9 до неопределяемых уровней.
- Надежное редактирование одного AAV в нескольких мышечных тканях: NanoCas продемонстрировал редактирование 10%–40% гена дистрофина в четырехглавой мышце, икроножной мышце и сердечной мышце в гуманизированной мышиной модели мышечной дистрофии Дюшенна (МДД) при доставке с помощью одного вектора AAV.
- Первая демонстрация редактирования одной мышцы AAV у нечеловекообразных приматов: NanoCas достигла эффективности редактирования in vivo до 30% при воздействии на дистрофин в скелетных мышцах яванских макак. NanoCas также показал редактирование 15% по всему сердцу по сравнению с 10% с SaCas9. Анализ ткани печени показал минимальное нецелевое редактирование.